Prof Dr Fatih Ağalar, Konya Maarif Koleji mezunudur, Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesini 1986 da bitirmiştir.
1988-1994 yılları arasında Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesinde Genel Cerrahi Uzmanlık Eğitimini tamamladıktan sonra aynı kurumda 1998 yılına kadar görev yapmıştır.
1988’de Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fakültesi Genel Cerrahi Anabilim Dalında Yardımcı Doçent Kadrosuna atanmıştır. 1999’da doçent olmuştur. Aynı Kurumda Araştırma Hastaneleri Acil Tıp Anabilim Dalı Başkanlığı görevinde bulunmuş ve Acil Tıp AD kurucu öğretim üyesi olmuştur.
2001-2003 arasında Yıldırım Beyazıt Ankara Eğitim ve Araştırma Hastanesinde görev yapmıştır.
2003 – 2011 tarihleri arasında Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Genel Cerrahi Anabilim Dalında görev yapmıştır. 2005 yılında profesör olmuştur. 2003-2011 yılları arasında Anabilim Dalı Başkanlığı görevini sürdürmüştür.
2005-2010 yılları arasında Cerrahi Tıp Bilimleri Başkanlığı, 2006 yılında Tıp Fakültesi Dekanlığı görevini yürütmüştür. Aynı kurumda Üniversite Yönetim Kurulu, Fakülte Yönetim Kurulu ve Üniversite Senato Üyeliği yapmıştır.
